Kirik Hagia Sophia ehitati keset VII sajandil varemetele kolm korda pikem tema varakristlik basiilika ja Bütsantsi ajal oli ta ümbritsetud paljude hoonete kultus ja administratiivsetel eesmärkidel. Kuna 1585 sai kirikust mošee, kuid uuesti pühitseti kirik 1912.

Ajaloo- ja arheoloogilised leiud näitavad, et pikihoone ja lõunaosas sammastik Püha Sophia templi maeti metropolitans Thessaloniki, näiteks Grigoros Kutalis ja Konstantin Mesopotamitis.

Kiriku interjöör on kaunistatud rohkete mosaiigid ja freskod IX-X sajandil. Fresko 'ülestõusmine "kaunistab kuppel kirik.