Teine atraktsioon Cordoba - San Francisco kirik, mis on üks nn "ferdinandovskih" kirikud, sai oma nime sellest, et nad olid esimesed kristliku kiriku ehitatud Cordoba pärast reconquest alates maurid kuningas Ferdinand III. Kui kirik ehitati osa 13. sajandi klooster San Pedro El Real. Klooster, mis kuulus frantsiskaani usukogukondade olla päris lähedale aega ja oli suur mõju religioosse elu linnas. On teada, et 17. sajandil elas sada munka, ja kõige selle heaolu ja mõju ta on saavutanud 18. sajandil. Aga 19. sajandi alguses, ajal ette Napoleoni väed kloostri hävis ja kiriku San Francisco imekombel ellu.

Algselt loodud gooti stiilis, täna kiriku ehitust San Francisco on ainult osaliselt sarnaneb algse struktuuri. Kogu 18. sajandi restaureeriti hoone mitu korda ja selle fassaad on palju elemente barokk, oluliselt muutunud keskaegse ilme kirik.

Täna, Church of San Francisco ei ole ainult üks vanimaid, vaid ka üks rikkamaid kirikud Cordoba. See sisaldab rikkalikult kultuuriväärtusi kogunenud keskaja. Seal on ka huvitav maalikogu kunstnikud 18. sajandi Cordova. See väärib erilist tähelepanu ja hea mööbliga, mis asuvad ruumid templi.