Ehitus uue hoone kloostri Santa Clara Coimbra käivitati 1649. aastal. Vana klooster, ehitatud lõpus XIII sajandil, hävis, ja otsustati ehitada uus hoone nunnad ordeni Santa Clara.

Projekti käigus töötati benediktiini munk kloostri ja kuninglik arhitekt João Turriano, vastutab ehituse kuninglik arhitekt Mateus do Couto. Uus Ehitus kestis piisavalt kaua. Aastal 1677 uus hoone kloostri, mis sai tuntuks kui kloostri Santa Clara-a-Nova, sõitis nunnad. 1696. aastal sai kirik õnnistati.

Peamised portaali kloostri kirik on kaunistatud kuninglik vapp, mis toetavad kaks inglit. Interjöör on kirik barokkstiilis. Kirik on ühelööviline, transept puudub. Külg kabelid ja peamine kabel on kaunistatud 14 altarpieces XVII sajandi stiilis "Talya dorado" - altarpieces raamitud nikerdatud ja kullatud puust. Lisaks uue kloostri viidi haud jääb Queen Isabella Portugali asutaja kloostri. Pärast abikaasa surma kuningas Dinis, kuninganna oli Coimbra kloostri Santa Clara kuni surmani ja maeti sinna. Seega, kohalike hulgas selle kloostri nimetatakse kloostri kuninganna Isabella. Haud tuhaga, valmistatud hõbedast ja kristall, mis asub lähedal peamiste altaril. Enne kiriku seisab mälestusmärk kuninganna Isabella, skulptor Antonio Teixeira Lopes XIX sajandil.

1733 kloostri kloostreid ehitatud renessanss-stiilis. Ehituse need galeriid vastutab Ungari arhitekt Carlos Mardel.