Botaanikaaed ehitati 1772-1774 aastat. Peaaegu kohe pärast selle asutamisest liitunud National History Museum, looja, mis oli markii Pombal. Koht Aed valitud asekantsler Ülikooli Coimbra, Francisco de Lemos. Aed asub maal, mis kuulusid School of St. Bento, mille asukoht oli Ursulines Valley. Esimene kuraator aed oli Domingos Vandelli ja 1791. asendati ta Felik Alevar Brotero, professor botaanika ja põllumajandus. Aed on pidevalt laienenud, seal olid uued näidised taimed ja hetkel aed pindala on 13 hektarit.

Botaanikaaia Coimbra ülikooli on üks ilusamaid aedu Euroopas ja koosneb kahest osast. Üks osa sellest asub mäe ja jaguneb terrassid. Alumine terrass nimetatakse Kvadrado Kesk- ja on vanim osa aiast. Terrass on kaunistatud purskkaev 40s, näete istutatud päevil Felix Brotero kureerida aed. Dekoorelemendid terrassid on palju ühist Decor Euroopa aedades XVIII sajandil. Teisel terrass näete kasvuhoonetes troopiline ja subtroopiline puud ja lillepeenrad terve taim peredele. Need peenardele jagatud rühmadesse taksonoomiliselt ja kasvatatakse kasutamiseks üliõpilased, botaanikud, samuti vahetada teiste samalaadsete institutsioonide üle maailma, mis on botaanikaaiad.

Teises osa aiast levib üle oru, mille kaudu voolab väike oja ja kus asub arboreetumi. Seal on palju kasvab bambus puud ja muud eksootilised taimed. Ka teine ​​osa aiast on tuntud oma suurepärase kogumise eukalüpti (51 liiki). Aias elusaid kodulinde. Pered pruun oravad on osa ökosüsteemi, on edukalt rakendatud 1994. aasta juunis. Valgud olid esimesed loomad, kes on hästi kohanenud keskkonnaga ja hakkas paljunema.